Томдинский район образован в 1928 году и граничит с Туркестанской и Кызылординской областями Республики Казахстан на северо-востоке, Конимехским районом Навоийской области на юго-востоке, Учкудукским районом на западе и Республикой Казахстан на севере в центре на 237,5 км примыкает к государственная граница.